Санкт-Петербургское государственное казенное учреждение «Мелиоративная система Санкт-Петербурга» создано Администрацией Санкт-Петербурга с целью материально-техническое обеспечения полномочий Комитета по природопользованию, охране окружающей среды и обеспечению экологической безопасности по осуществлению государственного управления в области мелиорации земель, по организации содержания в исправном (надлежащем) состоянии государственных мелиоративных систем, находящихся в собственности Санкт-Петербурга, и отнесенных к государственной собственности отдельно расположенных гидротехнических сооружений, по согласованию сооружения и эксплуатации линий связи, электропередач, трубопроводов, дорог и других объектов на мелиорируемых (мелиорированных) землях.